За каденції В.А. Ющенка він особисто зустрічався з Президентом, який пообіцяв Слюсарчуку створити та віддати під керівництво останнього Інститут Мозку, а за президентства В.Ф. Януковича Слюсарчук був нагороджений Державною премією України в галузі освіти.
14 листопада 2011 заарештований за звинуваченням у підробленні документів і шахрайстві. 14 лютого 2014 Сихівський райсуд Львова засудив Слюсарчука до восьми років позбавлення волі. Суд визнав його винним у використанні підроблених документів, здійсненні незаконної лікувальної діяльності, пов'язаної із заподіянням потерпілим тяжких тілесних ушкоджень, вбивством з необережності двох людей, заволодінні шляхом обману чужим майном. Він оскаржив вирок. Але апеляція його скаргу не задовольнила. Тепер "Доктор Пі" відбуває покарання на Рівне нщині . Андрій Слюсарчук прибув до Полицької виправної колонії наприкінці червня. Там в установі середнього рівня безпеки відбувають покарання засуджені вперше.